针对目前部分主要农产品价格内外倒挂明显、农产品库存庞大等问题，国家将在“十三五”期间将进行一系列补贴制度和涉农财政资金投入方式改革。
　　补贴制度改革方向
　　“十三五”农业投入机制改革启动 将调整农业补贴对于接下来一段时间中国农业补贴改革的举措，多位专家透露，将以调整对生产和贸易产生扭曲作用的政府补贴(“黄箱”政策的一种)，逐步扩大“绿箱”政策实施规模和范围为主。具体而言，就是将中国目前农业补贴主体的良种补贴、农民直补和农资综合补贴等三项补贴政策合并为“农业支持保护补贴”。
　　目前补贴制度的“普惠制”弊端
　　目前中央财政对农业实施的各种补贴政策，主要都是以“普惠制”的方式实施，比如良种补贴、种粮直补、农资综合补贴和农机购置补贴(简称“四补贴”)，以及最低收购价、主要农产品临时收储政策(简称“托市政策”)。
　　农业部部长韩长赋在2014年全国两会上表示，2013年仅仅是“四补贴”，中央财政对口农民的直接补贴就高达1600多亿元。而在实施“托市政策”当中，中央财政为种粮、种地农民，为农村养殖户，所支付的各种补贴性收入，总计数额就更为巨大。如果再加上其它名目繁多的各种农业补贴，现在中央财政每年对农业的补贴已经超过1万亿元。
　　据农业部信息显示，2014年中央财政安排奖励资金35亿元，专项用于发展生猪生产，具体包括规模化生猪养殖户(场)圈舍改造、良种引进、粪污处理的支出，以及保险保费补助、贷款贴息、防疫服务费用支出等。同时，还有生猪良种补贴、病死猪无害化处理补助等多项政策性补贴。
　　下一步改革的大方向，将会向大户、规模经营和其它新型农业经营主体倾斜。
　　2015年养猪政策补贴种类及金额
　　1、生猪调出大县奖励
　　具体包括规模化生猪养殖户(场)圈舍改造、良种引进、粪污处理的支出，以及保险保费补助、贷款贴息、防疫服务费用支出等。奖励资金按照“引导生产、多调多奖、直拨到县、专项使用”的原则，依据生猪调出量、出栏量和存栏量权重分别为50%、25%、25% 进行测算。
　　2、畜牧良种补贴政策
　　生猪良种补贴标准为每头能繁母猪40元。
　　3、重大动物疫病强制免疫疫苗补助政策
　　国家对口蹄疫、高致病性猪蓝耳病、猪瘟等动物疫病实行强制免疫政策;疫苗经费由中央财政和地方财政共同按比例分担，养殖场(户)无需支付强制免疫疫苗费用。
　　4、畜禽疫病扑杀补助政策
　　国家对口蹄疫、高致病性猪蓝耳病发病动物及同群动物实施强制扑杀。国家对因上述疫病扑杀，给养殖者造成的损失予以补助，强制扑杀补助经费由中央财政、地方财政和养殖场(户)按比例承担。
　　5、基层动物防疫工作补助政策
　　补助经费主要用于对村级防疫员承担的为畜禽实施强制免疫等基层动物防疫工作的劳务补助。
　　6、养殖环节病死猪无害化处理补助政策
　　国家对年出栏生猪50头以上，对养殖环节病死猪进行无害化处理的生猪规模化养殖场(小区)，给予每头80元的无害化处理费用补助，补助经费由中央和地方财政共同承担。2015年，病死猪无害化处理补助范围由规模养殖场(区)扩大到生猪散养户。
　　7、生猪定点屠宰环节病害猪无害化处理补贴政策

　　国家对屠宰环节病害猪损失和无害化处理费用予以补贴，病害猪损失财政补贴标准为每头800 元，无害化处理费用财政补贴标准为每头80 元，补助经费由中央和地方财政共同承担。
　　8、农业保险支持政策
　　能繁母猪、育肥猪保险，中央财政对中西部地区补贴50%、对东部地区补贴40%、对中央单位补贴80%;地方财政至少补贴30%。